病毒感染进化假说

说起细菌和病毒，人们对它们既讨厌又恐惧。人类绝大多数的传染病是由细菌和病毒引起来的，消灭细菌和病毒是传染病医学的重要使命。1928年，弗来明发现抗生素以后， 抗生素成为人类对付细菌的最有效的方法。
其实并不是所有细菌对人有害，健康人的皮肤、呼吸道、消化道等部位都广泛存在着细菌。数量是人体细胞的10倍，重量是人体体重的1/50-1/100，生活在我们的体内，与我们同呼吸共命运，很多人意识不到它们的存在，它们是人类亲密而陌生的朋友，它们就是人体的共生菌群。如人的皮肤上经常存在着微球菌、链球菌、肠道杆菌、芽孢杆菌和螺旋体等微生物；鼻腔中常见的有类白喉杆菌、葡萄球菌，甚至有肺炎球菌和流感嗜血菌等；在肠道内，特别是大肠中含有大肠杆菌、产气杆菌、变形菌、产气荚膜菌、乳酸杆菌和螺旋体等。人体为它们提供了良好的栖息场所，而这些细菌生活在肠道中能合成硫胺素、核黄素、烟酸、维生素B12、维生素K等多种维生素以及氨基酸供应人体。实践证明，在肠道中如果没有这些微生物的存在，人体就不能维持正常的生活。例如：长期服用抗生素或磺胺类药物，就会引起肠道正常菌群的改变，从而使人体患菌群失调症。
正常菌群也是人体免疫系统正常发育的条件，科学家用各种手段培养出无菌动物，用无菌饲料喂养，呼吸无菌空气。发现无菌动物长得特别娇弱，必须供给多种维生素及氨基酸才能存活下去，而且免疫系统发育不全，正常动物的正常菌群都会造成感染。在长期的进化过程中，人与细菌形成和谐的共生，细菌离不开人，人也离不开细菌。
所以，当我们说一个人时，他其实不是一个个体，而是一个群落。这里也包括人体内的共生菌群，这些共生菌群的作用甚至比我们的手足的作用还要大，因为我们离开手足仍可活者，但离开这些菌群，则有生命危险。
的确，有的细菌可以导致疾病，但仅仅依靠消毒，我们并不能避免感染，仅仅依靠杀菌，我们并不能康复。健全的免疫系统在预防感染和康复中往往比消毒、杀菌更为重要。
寄生可以看作是生物合作的前奏，内共生学说则认为，真核细胞的线粒体和叶绿体分别是好氧菌和蓝藻侵入真核细胞中而形成的共生体。而寄生则是共生的前奏。聪明的寄生者知道，只有和寄主和平共处，甚至是为寄主服务才有更多的生存机会。否则，它必随着寄主的灭绝而灭绝。虽然这个合作的前奏是痛苦的传染病，仍应看作是自然的必然过程。人这样的复杂的哺乳动物其实就是多种生物的共生体。也可以说没有寄生就没有共生，没有共生就没有高等的生物，包括人。
更为重要的是细菌是生态系统的重要组成成份，是生物圈最主要的分解者，人和动物的遗体、粪便，植物的残枝落叶，都是由细菌分解的。如果没有细菌，不仅地球成为到处是尸体的坟场，到处是粪便的粪坑，而且植物也最终会因缺乏矿质营养而死亡。生物圈的碳循环，氮循环都会失去平衡而中断。我们不得不说在保持生态平衡上，细菌是不可替代的"功臣"。
一提起病毒，我们就想起传染病。人类有80%的传染病是由病毒引起的。对付病毒我们至今仍没有有效的方法，艾滋病在世界范围内肆虐，乙型肝炎病毒仅在我国有1亿3千万的病毒携带者，在世界范围内则有5亿携带者。非典病毒、禽流感病毒常常给人类找点小麻烦，而流感病毒则更是频繁光顾我们的身体。在传染病的战场，病毒是我们的敌人，消灭病毒拒绝感染，一直是现代医学的一个目标。
病毒是一种寄生生物，它如此高度地适应了寄生生活，以至于只留下蛋白质的衣壳和核酸。它的身体很小，多只有几十个纳米，这使它很容易地进入宿主细胞中，它结构简单，其核酸常常整合到宿主的核酸上，使得宿主的免疫系统对它无懈可击。
病毒广泛地寄生在动物、植物和真菌体内，甚至细菌这样的微生物都无法避免被病毒寄生的命运。
病毒的遗传物质--核酸很少，一般只有103--106对核苷酸，而哺乳动物细胞的核酸有5500×106